Deneyde Refik Saydam Hıfzı Sıhha Enstitüsü kültür koleksiyonu (RSKK), American Type Culture Collection (ATCC) ve Colorado State Üniversitesi’nden (N) temin edilen Listeria monocytogenes (RSKK 472, RSKK 474, RSKK 475, N 7143, N7144) ve E. coli O157:H7 (ATCC 43890, ATCC 43894, ATCC 51657, ATCC 43895, ATCC 35150) suşları kullanıldı.
İnokülumun Hazırlanması: L. monocytogenes ve E. coli O157:H7’nin belirtilen suşları –20 oC’den çıkarılarak, Tyrptic Soy Broth’a ekilerek (TSB, LABM, Lancashire, İngiltere) L. monocytogenes 30 oC ve E. coli O157:H7 35 ºC’de 24 saat inkübe edildi. Aside adapte suşları hazırlamak için %1 glukoz eklenmiş TSB içerisinde ve aside adapte edilmemiş suşları hazırlamak için ise glukoz içermeyen TSB içerisinde E. coli O157:H7 35 ºC’de, Listeria monocytogenes ise 30 ºC’de 24 saat inkübe edildi 10. Daha sonra her bir patojenin 5’er suşu santrifüj (4.200 rpm/15 dk.) edilerek (Nüve NF 800R, Ankara, Türkiye) üstte kalan süpernatant uzaklaştırıldı ve yaklaşık 9 mL steril %0.9’luk NaCl (serum fizyolojik) ilave edilerek pelet yıkandı ve tekrar santrifüj edildi. Santrifüj sonrası elde edilen her iki patojene ait peletlerden aside adapte edilenler ve aside adapte edilmemişler ayrı ayrı birleştirildi ve suşlar inokülasyon için hazır hale getirildi.
Şavak Tulum Peynirine Kontaminasyon Aşaması ve Analiz Günleri: Şavak tulum peynirinin yapım aşaması tamamlanmış, ancak olgunlaşma aşamasına geçmemiş olan peynir örneklerine, her bir patojenin aside adapte olmuş veya aside adapte olmamış şuşları kendi aralarında miks haline getirildi. İnokülasyon için hazırlanmış bakteri miksleri her iki patojen için yaklaşık olarak 6.00±1.00 log10 kob/g olacak şekilde peynir kitlesine ilave edildi. Daha sonra inokülumun homojen dağılımını sağlamak için peynirler en az 5 dk. boyunca manuel olarak karıştırıldı. Elde edilen kontamine edilmiş peynir örnekleri steril plastik konteynırlara konulduktan sonra 6 oC’de olgunlaşmaya bırakıldı. Mikrobiyolojik ve kimyasal analizler olgunlaşmanın 0, 15, 30, 45, 60, 90 ve 120. günlerinde yapıldı. Çalışma birbirinden bağımsız 3 tekrar ve her tekrarda tüm analizler 2 paralel olarak gerçekleştirildi.
Mikrobiyolojik Analizler: Peynir örneklerinden aseptik şartlar altında 25 g örnekler alındı ve 225 ml %0.1’lik steril peptonlu su (LABM, Lancashire, İngiltere) ilave edildi. Daha sonra 2 dakika boyunca karıştırıcıda (Stomacher 400) homojenize edildi ve desimal dilüsyonları yapılıp plaklara çift seri ekim yapıldı. Mikrobiyolojik analizlerde yayma plak yöntemi kullanıldı.
E. coli O157:H7 Sayımı: E. coli O57:H7 sayımı Cefixim Tellurite ilave Sorbitol MacConkey Agar (CT-SMAC) (LABM, Lancashire, İngiltere) besiyerinde yapıldı ve 35 oC’de 24 saat inkübe edildikten sonra 30–300 arasındaki beyaz renkli koloniler sayıldı 11.
L. monocytogenes Sayımı: Listeria monocytogenes sayımı PALCAM Agar (Oxoid, Basingstoke, Hants., İngiltere) besiyerinde yapıldı ve 30 ºC’de 24 saat inkübe edildikten sonra 30-300 arasındaki kahverengi-zeytuni renkli koloniler sayıldı 10.
Diğer Mikrobiyolojik Analizler: Lactobacillus spp. sayımı de Man Rogosa Sharpe Agar’da (MRS) (LABM) 30 °C’de 72 saat 12, Lactococcus spp. sayımı M17 Agar’da (LABM) 22 °C’de 72 saat 13, toplam mezofil aerob bakteri ve psikrofil bakteri sayımları da Plate Count Agar’da (PCA) (LABM) 35 °C’de 48-72 saat ve 7 °C’de 7 gün 14 inkübe edilerek yapıldı.
Kimyasal Analizler: pH tayini, pH metre (Selecta pH 2001, İspanya) ile daldırma yöntemine göre 15, peynirde toplam asitlik ve tuz tayini ise AOAC prosedürlerine göre 16,17 yapıldı.
İstatistiksel Analizler: Bakteri sayıları log10 kob/g'a çevrildi. Çalışmada parametrik testlerin ön şartlarından varyansların homojenliği “Levene” testi ile kontrol edilirken, normallik varsayımına ise “Shapiro-Wilk” testi ile bakılarak parametrik testler kullanılmıştır. Gruplar arası farklılıklar "Student t testi" ile belirlenirken zamanlar arası farklılıklara tek yönlü varyans analizi (ANOVA) ve post-hoc analizi olarak “Tukey” testi kullanılarak bakıldı. İstatistiksel önem seviyesi 0.05 olarak kabul edildi. Verilerin analizi, Statistical Analysis System (SAS) kullanılarak yapıldı 18.